• Facebook
  • Linkedin
  • Youtube

SARS-CoV-2 B.1.1.7 Soyunun Ortaya Çıkışı

Amerika Birleşik Devletleri, 29 Aralık 202012 Ocak 2021

Summer E. Galloway, Doktora 1;Prabasaj Paul, PhD 1 ;Duncan R. MacCannell, Doktora 2;Michael A. Johansson, Doktora 1;

John T. Brooks, Doktor 1;Adam MacNeil, Doktora 1;Rachel B. Slayton, Doktora 1;Suxiang Tong, Doktora 1;Benjamin J. Silk, Doktora 1;Gregory L. Armstrong, MD 2;

Matthew Biggerstaff, ScD 1 ;Vivien G. Dugan, Doktora

15 Ocak 2021'de bu rapor bir MMWR olarak yayınlandıMMWR web sitesinde (https://www.cdc.gov/mmwr) Erken Sürüm.

14 Aralık 2020'de Birleşik Krallık bildirdiilgili bir SARS-CoV-2 varyantı (VOC), soy B.1.1.7,VOC 202012/01 veya 20I/501Y.V1 olarak da anılır.*B.1.1.7 varyantının Eylül ayında ortaya çıktığı tahmin ediliyor2020 ve hızla dolaşımdaki baskın hale geldiİngiltere'de SARS-CoV-2 varyantı (1).B.1.1.7 olmuşturAmerika Birleşik Devletleri dahil 30'dan fazla ülkede tespit edildi.Gibi13 Ocak 2021 itibariyle, yaklaşık 76 B.1.1.7 vakasında12 ABD eyaletinde tespit edildi.Birden çok kanıt satırıB.1.1.7'nin olduğundan daha verimli bir şekilde iletildiğini gösterir.diğer SARS-CoV-2 varyantları (13).modellenen yörüngeABD'deki bu değişken, 2021'in başlarında hızlı bir büyüme sergiliyor,Mart ayında baskın değişken haline geliyor.ArtırılmışSARS-CoV-2 bulaşması, zor durumdaki sağlık hizmetlerini tehdit edebilirkaynaklar, genişletilmiş ve daha titiz uygulama gerektirirhalk sağlığı stratejileri (4) ve yüzdesini artırmakPandemi kontrolü için popülasyon bağışıklığı gereklidir.almaşimdi bulaşmayı azaltmak için önlemler potansiyeli azaltabilirB.1.1.7'nin etkisi ve aşılamayı artırmak için kritik süre sağlarkapsama alanı.Toplu olarak, geliştirilmiş genomik sürveyansetkili kamu ile sürekli uyum ile birlikteaşılama, fiziksel mesafe dahil olmak üzere sağlık önlemleri,maske kullanımı, el hijyeni, izolasyon ve karantina,virüs olan SARS-CoV-2'nin yayılmasını sınırlamak için gerekli olabilir2019 koronavirüs hastalığına (COVID-19) neden olan.StratejikSemptomları olmayan ancak daha yüksek risk altında olan kişilerin test edilmesiSARS-CoV-2'ye maruz kalanlar veya sahip olanlar gibi enfeksiyonhalkla sık sık kaçınılmaz temas, başka bir sağlardevam eden yayılmayı sınırlama fırsatı.

Küresel genomik gözetim ve hızlı açık kaynak paylaşımıviral genom dizilerinin oluşturulması neredeyse gerçek zamanlı olarak kolaylaştırılmıştır.gelişen SARS-CoV-2'nin tespiti, karşılaştırılması ve takibikontrol etmek için halk sağlığı çabalarını bilgilendirebilecek varyantlarpandemi.Viral genomdaki bazı mutasyonlar iseortaya çıkar ve sonra geri çekilir, diğerleri seçici bir ilerleme sağlayabilirGeliştirilmiş iletilebilirlik de dahil olmak üzere değişkene etiketleyin, böyleceböyle bir varyant, dolaşımdaki diğer varyantlara hızla hakim olabilir.

Salgının başlarında, SARS-CoV-2'nin varyantları şunları içerir:artan spike (S) proteinindeki D614G mutasyonuReseptör bağlama aviditesi, birçok insanda hızla baskın hale geldi.coğrafi bölgeler (5,6).2020 sonbaharının sonlarında, birden fazla ülke tespit edildiğini bildirdiDaha verimli yayılan SARS-CoV-2 varyantları.Ek olarakB.1.1.7 varyantına göre, dikkate değer varyantlar B.1.351'i içerirsoy ilk olarak Güney Afrika'da tespit edildi ve yakın zamanda tespit edildiB.1.1.28 alt sınıf (yeniden adlandırıldıP.1) dört gezginde tespit edildiHaneda'da (Tokyo) rutin tarama sırasında Brezilya'danhavalimanı.§ Bu varyantlar, bir genetik muta takımyıldızı taşır.S proteini reseptör bağlama alanı da dahil olmak üzere,konakçı hücreye bağlanmak için gerekli olan anjiyotensin-virüsü kolaylaştırmak için enzim-2 (ACE-2) reseptörünü dönüştürmekgiriş.Kanıtlar, bunlarda bulunan diğer mutasyonlarınVaryantlar sadece daha fazla aktarılabilirlik sağlamakla kalmaz, aynı zamandabazı teşhis gerçek zamanlı performansını da etkileyebilir.ters transkripsiyonpolimeraz zincir reaksiyonu (RT-PCR)tahlillerve nötralize edici antikorlara duyarlılığı azaltır(2,3,510).Yakın tarihli bir vaka raporu, ilk vakayı belgeledi.Brezilya'da bir SARS-CoV-2 varyantı ile SARS-CoV-2 yeniden enfeksiyonugösterilen E484K mutasyonunu** içereniyileşme serumları ve monoklonal ile nötralizasyonu azaltmak içinantikorlar (9,10).

Bu rapor, B.1.1.7 varyantının ortaya çıkışına odaklanmaktadır.Birleşik Devletlerde.12 Ocak 2021 itibarıyla neB.1.351 veya P.1 varyantları,Amerika Birleşik Devletleri.Gelişmekte olan SARS-CoV-2 hakkında bilgi içinEndişe varyantları, CDC adanmış bir web sayfası tutarortaya çıkan SARS-CoV-2 varyantları hakkında bilgi sağlamak.††

 B.1.1.7 soy (20I/501Y.V1)

B.1.1.7 varyantı, S proteininde bir mutasyon taşır(N501Y), reseptör bağlanmasının konformasyonunu etkilerihtisas.Bu varyant, birçoğu S proteininde bulunan 13 başka B.1.1.7 soy tanımlayıcı mutasyona (Tablo) sahiptir.69 ve 70 konumlarında bir silme dahil (del6970)diğer SARS-CoV-2 varyantlarında kendiliğinden gelişti vegeçirgenliği arttırdığı varsayılmıştır (2,7).Silme69 ve 70 pozisyonlarında S-geni hedef hatasına (SGTF) neden oluren az bir RT-PCR'detabanlı tanı testi (yani,ThermoFisher Taq Path COVID-19 testi, B.1.1.7 değişkenikarınca ve del69 ile diğer değişkenler70 negatif üretirS-gen hedefi için sonuç ve diğer ikisi için pozitif sonuçhedefler);SGTF, Birleşik Krallık'ta vekil olarak görev yaptıB.1.1.7 vakalarını belirlemek için (1).Çok sayıda kanıt, B.1.1.7'nin daha fazla olduğunu gösteriyordiğer SARS-CoV-2 ile karşılaştırıldığında verimli bir şekilde iletilirBirleşik Krallık'ta dolaşan varyantlar.Birleşik Krallık bölgeleriB.1.1.7 dizilerinin daha yüksek bir oranı daha hızlı salgına sahiptidiğer alanlara göre büyüme, SGTF ile teşhis arttıaynı alanlarda SGTF olmayan teşhislerden daha hızlı vetemaslıların daha yüksek oranı indeks hastalar tarafından enfekte edildiB.1.1.7 enfeksiyonları ile enfekte indeks hastalara görediğer değişkenler (1,3).Varyant B.1.1.7, ABD panını artırma potansiyeline sahiptirönümüzdeki aylarda demik yörünge.Bu etkiyi göstermek için,basit, iki değişkenli bir bölme modeli geliştirildi.Tüm dolaşımdaki B.1.1.7'nin mevcut ABD prevalansıvirüsler bilinmemektedir ancak <%0,5 olduğu düşünülmektedir.sınırlı sayıda vaka tespit edildi ve SGTF verileri (8).İçinmodel, ilk varsayımlar bir B.1.1.7 yaygınlığını içeriyordutüm enfeksiyonlar arasında %0,5, SARS-CoV-2 bağışıklığıönceki enfeksiyon %10%30, zamanla değişen üremesayı (R t ) 1.1 (hafifletilmiş ancak artan iletim)veya mevcut varyantlar için 0,9 (azalan bulaşma) ve günde 100.000 kişi başına 60 vaka olarak bildirilen insidans1 Ocak 2021. Bu varsayımlar tam olarak temsil etmemektedir.herhangi bir tek ABD konumu, bunun yerine, bir genellemeyi belirtirülke genelinde yaygın olan durumlar.R t üzerindeki değişimkazanılmış bağışıklık ve artan prevadan kaynaklanan zamanB.1.1.7'nin değeri, B.1.1.7 R t varsayılarak modellenmiştirmevcut varyantların R t'sinin 1,5 katı bir sabit olmak,Birleşik Krallık'tan ilk tahminler (1,3).Ardından, aşılamanın potansiyel etkisi modellenmiştir.başına 1 milyon aşı dozu uygulandığı varsayılarak1 Ocak 2021 ile başlayan gün ve bu %95 dokunulmazlık2 dozun alınmasından 14 gün sonra elde edildi.özellikle,mevcut varyantlar veya mevcut varyantlar ile enfeksiyona karşı bağışıklıkB.1.1.7 varyantı varsayılmıştır, ancak etkinlik veenfeksiyona karşı koruma süresi belirsizliğini koruyor,çünkü bunlar klinik deneylerin birincil sonlanım noktası değildi.İlk aşılar için.Bu modelde, B.1.1.7 yaygınlığı başlangıçta düşüktür, ancakmevcut varyantlardan daha bulaşıcıdır, sergiler2021'in başlarında hızlı büyüme, baskın değişken haline geliyorMart ayında karınca (Şekil 1).akım iletimi olsundeğişkenler artıyor (ilk R t = 1.1) veya yavaş yavaş azalıyor(ilk R t = 0,9) Ocak ayında, B.1.1.7 önemli bir değişikliğe neden olduiletim yörüngesinde ve üstel yeni bir aşamadabüyüme.Enfeksiyona karşı koruyan aşılama ileerken salgın yörüngeleri değişmez ve B.1.1.7 yayılırhala oluşur (Şekil 2).Ancak, B.1.1.7'den sonrabaskın varyant, iletimi önemli ölçüde azaltıldı.Yakın çevrede bulaşmayı azaltmada aşılamanın etkisiterimi, iletimin olduğu senaryoda en yüksekti.zaten azalıyor (ilk R t = 0.9) (Şekil 2).Erken çabalarevrensel gibi B.1.1.7 varyantının yayılmasını sınırlayabilir vehalk sağlığı risk azaltma stratejilerine artan uyum,devam eden aşılama için daha fazla zaman sağlayacaktır.nüfus düzeyinde bağışıklık

Tartışma

Şu anda, klinik sonuçlarda bilinen bir fark yoktur.açıklanan SARS-CoV-2 varyantları ile ilişkili;Yine de,daha yüksek bir bulaşma oranı daha fazla vakaya yol açacaktır, artangenel olarak klinik bakıma ihtiyaç duyan kişi sayısı, daha şiddetliHalihazırda gergin olan sağlık sisteminin yükünü hafifletmek,ve daha fazla ölümle sonuçlanır.Devam eden genomik sürveyansB.1.1.7 vakalarının yanı sıra diğer vakaların ortaya çıkışını belirlemek içinAmerika Birleşik Devletleri'ndeki endişe varyantları,COVID-19 halk sağlığı müdahalesi.Oysa SGTF sonuçlarıdoğrulanabilecek potansiyel B.1.1.7 vakalarının belirlenmesine yardımcı olabilirsıralama yaparak, sergilemeyen öncelik varyantlarını belirleyerekSGTF, yalnızca sekans tabanlı gözetime dayanır.

 

 

 

Varyant tanımlaması

İlk kimlik  

karakteristik mutasyonlar

(protein: mutasyon)

Sırası doğrulanmış mevcut vakaların sayısı sayısı

olan ülkeler

diziler

Konum Tarih Amerika Birleşik Devletleri Dünya çapında  
B.1.1.7 (20I/501Y.V1) Birleşik Krallık Eylül 2020 ORF1ab: T1001I, A1708D, I2230T,

del36753677 SGF

S: del6970 HV, del144 Y, N501Y,

A570D, D614G, P681H, T761I,

S982A, D1118H

ORF8: Q27stop, R52I, Y73C

N: D3L, S235F

76 15.369 36
B.1.351 (20H/501Y.V2) Güney Afrika Ekim 2020 ORF1ab: K1655N

E: P71L

N: T205I

S:K417N, E484K, N501Y, D614G,

A701V

0 415 13

 

P.1 (20J/501Y.V3 Brezilya ve Japonya Ocak 2021 ORF1ab: F681L, I760T, S1188L,

K1795Q, del36753677 SGF, E5662D

S: L18F, T20N, P26S, D138Y, R190S,

K417T, E484K, N501Y, D614G,

H655Y, T1027I

ORF3a: C174G

ORF8: E92K

ORF9: Q77E

ORF14: V49L

N: P80R

0 35 2

 

Kısaltmalar: del = silme;E = zarf proteini;N = nükleokapsid proteini;ORF = açık okuma çerçevesi;S = başak proteini.

Birleşik Krallık ve B.1.1.7 modellerindeki deneyimBu raporda sunulanlar, etkiyi daha bulaşıcı bir şekilde göstermektedir.Varyant, bir popülasyondaki vaka sayısına sahip olabilir.buBu varyantın artan bulaşabilirliği, daha da fazlasını gerektiriraşılama ve mitiga'nın titiz birleşik uygulamasıTedbirler (örneğin, mesafe, maskeleme ve el hijyeni)SARS-CoV-2'nin yayılmasını kontrol etmek için.Bu önlemler alınacaker ya da geç başlatılırsa daha etkilidirB.1.1.7 varyantının ilk yayılmasını yavaşlatmak için.Çabalarvakalarda daha fazla artış için sağlık sistemini hazırlamakgarantili.Artan bulaşabilirlik aynı zamanda daha yüksek anlamına gelirbeklenenden daha fazla aşılama kapsamına ulaşılmalıdır.halkı korumak için aynı düzeyde hastalık kontrolü sağlamakdaha az bulaşıcı varyantlarla karşılaştırıldığında.Akademik, endüstri, eyalet, bölgesel,aşiret ve yerel ortaklar, CDC ve diğer federal kurumlargenomik sürveyansı koordine ediyor ve geliştiriyor veAmerika Birleşik Devletleri genelinde virüs karakterizasyon çabaları.HKMSARS-CoV-2 aracılığıyla ABD sıralama çabalarını koordine ederHalk Sağlığı Acil Müdahale Sıralaması,Epidemiyoloji ve Gözetim (SPHERES)§§konsorsiyum,yaklaşık 170 katılımcı kurumu içeren ve SARS-CoV-2'nin kullanımını kolaylaştırmak için açık veri paylaşımını destekleyensıralama verileri.SARS-CoV-2 viral evrimini izlemek için CDC,anlamak için çok yönlü genomik sürveyans uygulamakepidemiyolojik, immünolojik ve evrimsel süreçlerviral soyoluşları şekillendiren (filodinamik);rehber salgınsoruşturmalar;ve algılamayı ve karakterize etmeyi kolaylaştırırolası reenfeksiyonların, aşının kırılma vakalarının veortaya çıkan viral varyantlar.Kasım 2020'de CDC kurulduUlusal SARS-CoV-2 Gerinim İzleme (NS3) programıyerel SARS-CoV-2'nin temsil edilebilirliğini artırmak içindiziler.Program 64 ABD halkıyla işbirliği yapıyorbir genomik sürveyans sistemini desteklemek için sağlık laboratuvarları;NS3 ayrıca SARS-CoV-2 örneklerinden oluşan bir koleksiyon oluşturuyor.halk sağlığı müdahalesini ve bilimsel desteği desteklemek için dizilerilgili mutasyonların etkisini değerlendirmek için araştırmamevcut önerilen tıbbi önlemler.CDC'nin sahip olduğuayrıca birkaç büyük ticari klinik laboratuvarla sözleşmelion binlerce SARS-CoV-2'yi hızla sıralamak için hikayelerher ay pozitif örnekler ve yedi akademik fon sağladıortaklıkla genomik sürveyans yürütecek kurumlarhalk sağlığı kurumları ile, böylece önemli ölçüde ekleyerekher yerden zamanında genomik sürveyans verilerinin mevcudiyetiBirleşik Devletler.Bu ulusal girişimlere ek olarak,birçok eyalet ve yerel halk sağlığı kurumu sıralama yapıyor

ŞEKİL 1. Mevcut SARS-CoV-2 varyantlarının ve B.1.1.7 varyantının simüle edilmiş vaka insidans yörüngeleri*,topluluk aşısı olmadığını varsayarsakve mevcut varyantlar için başlangıç ​​R t = 1,1 (A) veya başlangıç ​​R t = 0,9 (B)Amerika Birleşik Devletleri, OcakNisan 2021

 

Şekil 1
şekil 2
kısaltmalar
Şekil 1

Yerel epidemiyolojiyi daha iyi anlamak için SARS-CoV-2 vesalgına karşı halk sağlığı müdahalesini desteklemek.Bu rapordaki bulgular en az üç sınırlamaya tabidir.tasyonlar.İlk olarak, iletilebilirlikteki artışın büyüklüğüAmerika Birleşik Devletleri'nde gözlenenle karşılaştırıldığındaBirleşik Krallık belirsizliğini koruyor.İkincisi, yaygınlığıAmerika Birleşik Devletleri'ndeki B.1.1.7 de şu anda bilinmiyor, ancakvaryantların saptanması ve yaygınlık tahmini iyileşecektirgeliştirilmiş ABD gözetleme çabalarıyla.Son olarak, yerel mitigaölçütleri de oldukça değişkendir ve bu daR t .Burada sunulan belirli sonuçlar simülasyona dayanmaktadır.ve hafifletmelerde 1 Ocak'tan sonra herhangi bir değişiklik olmayacağı varsayılmıştır.B.1.1.7 varyant savaşının artan bulaşabilirliğihalk sağlığı stratejilerinin titiz bir şekilde uygulanmasınıiletimi azaltmak ve B.1.1.7'nin potansiyel etkisini azaltmak,aşılama kapsamını artırmak için kritik zaman satın alıyor.CDC'LERmodelleme verileri, evrensel kullanımın ve artan uyumluluğun olduğunu göstermektedir.hafifletme önlemleri ve aşılama ile ance çok önemlidirYeni vaka ve ölüm sayılarını önemli ölçüde azaltmakgelecek aylar.Ayrıca, olmayan kişilerin stratejik testiCOVID-19 semptomları olan, ancak yüksek risk altında olanlarSARS-CoV-2 ile enfeksiyon, başka bir fırsat sağlardevam eden yayılmayı sınırlayın.Toplu olarak, gelişmiş genomik sürveyanshalk sağlığı ile artan uyum ile birleştirilmiş mızrakaşılama, fiziksel mesafe dahil hafifletme stratejilerimaske kullanımı, el hijyeni, izolasyon ve karantina,SARS-CoV-2'nin yayılmasını sınırlamak için gerekli olacak vehalk sağlığını korumak.

teşekkürler

Halk Sağlığı Acil Durumu Sıralaması ÜyeleriMüdahale, Epidemiyoloji ve Gözetim konsorsiyumu;eyalet ve yerelhalk sağlığı laboratuvarları;Halk Sağlığı Laboratuvarları Birliği;CDC COVID-19 Müdahale Ekibi;Solunum Virüsleri Şubesi,Viral Hastalıklar Bölümü, CDC.Committee of Medical Journal Editors formuçıkar çatışmaları.Herhangi bir potansiyel çıkar çatışması açıklanmamıştır.

Referanslar

1. Halk Sağlığı İngiltere.Yeni SARS-CoV-2 varyantının araştırılması: ilgili varyant 202012/01, teknik brifing 3. Londra, Birleşik Krallık: Public Health England;2020. https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/950823/Variant_of_Concern_VOC_202012_01_Technical_Briefing_3_-_England.pdf
2. Kemp SA, Harvey WT, Datir RP, et al.SARS-CoV-2 başak silme ΔH69/V70'in tekrarlayan ortaya çıkışı ve iletimi.bioRxiv[Ön baskı çevrimiçi olarak 14 Ocak 2021'de yayınlandı].https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.12.14.422555v4
3. Cilt E, Mishra S, Chand M, et al.İngiltere'de SARS-CoV-2 soyu B.1.1.7'nin iletimi: epidemiyolojik ve genetik verilerin bağlanmasından elde edilen bilgiler.medRxiv [Ön baskı çevrimiçi olarak 4 Ocak 2021'de yayınlandı].https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.12.30.20249034v2
4. Honein MA, Christie A, Rose DA ve diğerleri;CDC COVID-19 Müdahale Ekibi.SARS-CoV-2'nin toplumda yüksek düzeyde bulaşmasını ve buna bağlı ölümleri ele alan halk sağlığı stratejilerine ilişkin rehberliğin özeti, Aralık 2020. MMWR Morb Mortal Wkly Rep 2020;69:1860–7.PMID:33301434 https://doi.org/10.15585/mmwr.mm6949e2
5. Cilt E, Tepe V, McCrone JT, ve diğ.;COG-UK Konsorsiyumu.SARS-CoV-2 başak mutasyonu D614G'nin bulaşıcılık ve patojenite üzerindeki etkilerinin değerlendirilmesi.Hücre 2021;184:64–75.e11.PMID:33275900 https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.11.020
6. Korber B, Fischer WM, Gnanakaran S, et al.;Sheffield COVID-19 Genomik Grubu.SARS-CoV-2 artışındaki değişiklikleri izleme: D614G'nin COVID-19 virüsünün bulaşıcılığını artırdığına dair kanıt.Hücre
2020;182:812–27.PMID:32697968 https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.06.043
7. McCarthy KR, Rennick LJ, Namnulli S ve ark.SARS-CoV-2 başak glikoproteindeki doğal delesyonlar, antikor kaçışına neden olur.bioRxiv [Ön baskı çevrimiçi olarak 19 Kasım 2020'de yayınlandı].https://www.biorxiv.org/content/
10.1101/2020.11.19.389916v18.Washington NL, White S, Schiabor KM, Cirulli ET, Bolze A, Lu JT.S SARS-CoV-2 testlerindeki gen bırakma paternleri, H69del/V70del mutasyonunun ABD'de yayıldığını gösteriyor.medRxiv [Ön baskı çevrimiçi olarak 30 Aralık 2020'de yayınlandı].https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.12.24.20248814v1
9. Weisblum Y, Schmidt F, Zhang F, et al.SARS-CoV-2 başak protein varyantları tarafından nötralize edici antikorlardan kaçış.eLife 2020;9:e61312.PMID:33112236 https://doi.org/10.7554/eLife.61312
10. Greaney AJ, Loes AN, Crawford KHD, et al.Poliklonal insan serum antikorları tarafından tanınmayı etkileyen SARS-CoV-2 reseptör bağlama alanına yönelik mutasyonların kapsamlı haritalaması.bioRxiv [Ön baskı çevrimiçi olarak 4 Ocak 2021'de yayınlandı].https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.12.31.425021v1


Gönderim zamanı: 11 Şubat-2021