Amerikalı bilim adamı Eric S. Lander'in 1996'da üçüncü nesil moleküler belirteç olarak tek nükleotit polimorfizmini (SNP) resmen önermesinden sonra, SNP ekonomik özellik ilişkilendirme analizinde, biyolojik genetik bağlantı haritası yapımında ve insan patojenik gen taramasında yaygın olarak kullanıldı., Hastalık riski teşhisi ve tahmini, bireyselleştirilmiş ilaç taraması ve diğer biyolojik ve tıbbi araştırma alanları.Nakit ürün ıslahı alanında, SNP'nin tespiti, gerekli özelliklerin erken seçimini gerçekleştirebilir.Bu seçim, yüksek doğruluk özelliklerine sahiptir ve morfoloji ve çevresel faktörlerin karışmasını etkili bir şekilde önleyebilir, böylece üreme sürecini büyük ölçüde kısaltır.Bu nedenle SNP, temel araştırma alanında büyük bir rol oynamaktadır.

Tek Nükleotid Polimorfizmi (Tek Nükleotid Polimorfizmi, SNP), aynı veya farklı türden bireylerin DNA diziliminde aynı pozisyonda tek nükleotid farklılıkları olması olgusunu ifade eder.Tek bir bazın eklenmesi, silinmesi, dönüştürülmesi ve tersine çevrilmesi bu farklılığa neden olabilir.Geçmişte, SNP'nin tanımı mutasyonunkinden farklıydı.Bir değişken lokus, bir SNP lokusu olarak tanımlanabilmek için popülasyondaki alellerden birinin sıklığının %1'den fazla olmasını gerektirir.Bununla birlikte, modern biyolojik teorilerin genişlemesi ve teknolojinin uygulanmasıyla, alel frekansı artık SNP'nin tanımını sınırlamak için gerekli bir koşul değildir.Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi (NCBI) altındaki Tek Nükleotid Polimorfizmleri (dbSNP) veri tabanında yer alan tek nükleotit varyasyon verilerine göre, düşük frekanslı ekleme/delesyon, mikro uydu varyasyonu vb. de dahildir.

İnsan vücudunda SNP sıklığı %0.1'dir.Başka bir deyişle, 1000 baz çifti başına ortalama bir SNP sitesi vardır.Görülme sıklığı nispeten yüksek olmasına rağmen, tüm SNP bölgeleri, özelliklerle ilgili aday belirteçler olamaz.Bu, esas olarak SNP'nin meydana geldiği konumla ilgilidir.

Teorik olarak, SNP, genom dizisinin herhangi bir yerinde meydana gelebilir.Kodlama bölgesinde meydana gelen SNP'ler eşanlamlı mutasyonlar ve eşanlamlı olmayan mutasyonlar üretebilir, yani mutasyondan önce ve sonra amino asit değişir veya değişmez.Değişen amino asit genellikle peptit zincirinin orijinal işlevini kaybetmesine (yanlış mutasyon) neden olur ve ayrıca çevirinin kesilmesine (saçma mutasyon) neden olabilir.Kodlamayan bölgelerde ve genler arası bölgelerde ortaya çıkan SNP'ler, mRNA eklenmesini, kodlayıcı olmayan RNA dizisi bileşimini ve transkripsiyon faktörleri ile DNA'nın bağlanma etkinliğini etkileyebilir.Spesifik ilişki şekilde gösterilmiştir:

SNP Türleri:

Birkaç yaygın SNP tipleme yöntemi ve bunların karşılaştırılması

Farklı prensiplere göre, ortak SNP algılama yöntemleri aşağıdaki kategorilere ayrılır:

Algılama yöntemlerinin sınıflandırma karşılaştırması

Not: Tabloda şu anda kullanılan daha yaygın SNP tespit yöntemleri listelenmiştir, spesifik bölge hibridizasyonu (ASH), spesifik bölge primer uzantısı (ASPE), tek baz uzantısı (SBCE), spesifik bölge kesimi (ASC), gen çipi teknolojisi, kütle spektrometresi teknolojisi vb. gibi diğer tespit yöntemleri sınıflandırılmamış ve karşılaştırılmamıştır.

Yukarıdaki birkaç yaygın SNP tespit yönteminde nükleik asit saflaştırmasının maliyeti ve süresi kaçınılmazdır.Bununla birlikte, Foregene'nin doğrudan PCR teknolojisine dayanan ilgili kitler, saflaştırılmamış numuneler üzerinde doğrudan PCR veya qPCR amplifikasyonu gerçekleştirebilir, bu da SNP tespitine benzeri görülmemiş bir kolaylık sağlar.

Foregene'nin doğrudan PCR serisi ürünleri, şablonları hazırlamak için gereken süreyi ve maliyeti büyük ölçüde azaltan örnek saflaştırma adımlarını basitçe ve kabaca atlar.Eşsiz Taq polimeraz, mükemmel amplifikasyon yeteneğine sahiptir ve karmaşık amplifikasyon ortamlarından çeşitli inhibitörleri tolere edebilir.Bu özellikler, yüksek verimli spesifik ürünler elde etmek için teknik bir garanti sağlar. Hayvan dokuları (sıçan kuyruğu, zebra balığı vb.), bitki yaprakları, tohumlar (polisakkaritler ve polifenol numuneleri dahil), vb. gibi çeşitli numune türleri için Foregene Direct PCR/qPCR kitleri.